Sztuczna inteligencja analizuje struktury DNA

FARMAKOTERAPIA

Autor: PAP/ rynekaptek.pl   11-12-2017, 15:21

Sztuczna inteligencja analizuje struktury DNA DeepVariant działa poprzez analizę wariantów zawartych w sekwencji DNA zwracając jedną, długą sekwencję (fot. archiwum)

Sztuczna inteligencja, której pierwotnym zadaniem była analiza obrazów w celu ich rozpoznawania, nauczyła się analizować struktury DNA pod kątem występujących w nich mutacji. W tym tygodniu ukazała się najnowsza wersja algorytmu - DeepVariant.

DeepVariant działa poprzez analizę wariantów zawartych w sekwencji DNA zwracając jedną, długą sekwencję. Tymczasem, do tej pory problemem była fragmentacja nachodzących na siebie ciągów danych, które zwracały urządzenia służące do analizy sekwencji. Fragmenty przez nie zwrócone podlegały w dalszej kolejności analizie oraz porównaniom z genomami, których sekwencje są już znane.

Algorytm stworzony przez Google został wyszkolony w oparciu o duże ilości danych, które pozwoliły mu na zidentyfikowanie części informacji mających większy wpływ na fragment DNA a także tych, które są całkowicie pozbawione wpływu na sekwencję. 

Aby do analizy DNA wykorzystać algorytm, którego wcześniejszym zadaniem było rozpoznawanie obrazów, zespół badaczy Google'a postanowił przedstawić sekwencje genotypu za ich pomocą. Kolejnym składnikom analizy przypisano kolory: literom tworzącym sekwencję - kolor czerwony, jakości sekwencji dla określonej lokalizacji - kolor zielony, dookreśleniu nici splotu DNA, w której znajduje się lokalizacja - kolor niebieski. Połączone barwy stworzyły rozpoznawalny dla algorytmu format znany jako RGB (Red, Green, Blue - PAP).

Obecnie DeepVariant analizuje siedem warstw danych, a nie jedynie trzy określane przez kolory. Według badaczy, jego zastosowanie obecnie nie zmieni wyników prowadzonych badań genetycznych, ale z pewnością wyznacza nowy kierunek rozwoju dla zastosowania sztucznej inteligencji.

Zdaniem zespołu odpowiedzialnego za stworzenie algorytmu DeepVariant, pomysł stosowania wielowarstwowych struktur danych, z jakich korzysta mechanizm, może być pomocny również dla rozwiązywania innych problemów genetyki, takich jak np. prognozowanie wpływu określonych mutacji na organizm.

Podobał się artykuł? Podziel się!
comments powered by Disqus

BĄDŹ NA BIEŻĄCO Z FARMACJĄ!

Newsletter

Najważniejsze informacje portalu rynekaptek.pl prosto na Twój e-mail

Rynek Aptek: polub nas na Facebooku

Rynek Aptek: dołącz do nas na Google+

RSS - wiadomości na czytnikach i w aplikacjach mobilnych

OSTATNIO KOMENTOWANE

POLECAMY W PORTALACH

Drodzy Użytkownicy!

W związku z odwiedzaniem naszych serwisów internetowych przetwarzamy Twój adres IP, pliki cookies i podobne dane nt. aktywności lub urządzeń użytkownika. Jeżeli dane te pozwalają zidentyfikować Twoją tożsamość, wówczas będą traktowane jako dane osobowe zgodnie z Rozporządzeniem Parlamentu Europejskiego i Rady 2016/679 (RODO).

Administratora tych danych, cele i podstawy przetwarzania oraz inne informacje wymagane przez RODO znajdziesz w Polityce Prywatności pod tym linkiem.

Jeżeli korzystasz także z innych usług dostępnych za pośrednictwem naszych serwisów, przetwarzamy też Twoje dane osobowe podane przy zakładaniu konta, rejestracji na eventy, zamawianiu prenumeraty, newslettera, alertów oraz usług online (w tym Strefy Premium, raportów, rankingów lub licencji na przedruki).

Administratorów tych danych osobowych, cele i podstawy przetwarzania oraz inne informacje wymagane przez RODO znajdziesz również w Polityce Prywatności pod tym linkiem. Dane zbierane na potrzeby różnych usług mogą być przetwarzane w różnych celach, na różnych podstawach oraz przez różnych administratorów danych.

Pamiętaj, że w związku z przetwarzaniem danych osobowych przysługuje Ci szereg gwarancji i praw, a przede wszystkim prawo do sprzeciwu wobec przetwarzania Twoich danych. Prawa te będą przez nas bezwzględnie przestrzegane. Jeżeli więc nie zgadzasz się z naszą oceną niezbędności przetwarzania Twoich danych lub masz inne zastrzeżenia w tym zakresie, koniecznie zgłoś sprzeciw lub prześlij nam swoje zastrzeżenia pod adres odo@ptwp.pl.

Zarząd PTWP-ONLINE Sp. z o.o.